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Enregistrement W2073259806 · doi:10.4161/rna.8.2.15200

In vitro and in vivo cleavage of HIV-1 RNA by new SOFA-HDV ribozymes and their potential to inhibit viral replication

2011· article· en· W2073259806 sur OpenAlexafffund
Sébastien Lainé, Robert J. Scarborough, Dominique Lévesque, Ludovic Didierlaurent, Kaitlin J. Soye, Marylène Mougel, Jean‐Pierre Perreault, Anne Gatignol

Notice bibliographique

RevueRNA Biology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis C virus research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésRibozymeBiologyRNAVirologyLigase ribozymeViral replicationTransfectionMammalian CPEB3 ribozymeMolecular biologyVirusCell cultureGeneBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RNA-based compounds are promising agents to inactivate viruses. New specific hepatitis delta virus (HDV)-derived ribozymes are natural molecules that can be engineered to specifically target a viral RNA. We have designed specific on-off adaptor (SOFA)-HDV ribozymes targeting the tat and rev sequences of the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) RNA. We show that the SOFA-HDV ribozymes cleave their RNA target in vitro. They inhibit the Tat-mediated transactivation of HIV-1 from 62% to 86% in different assays. In vivo, the amount of HIV RNA was decreased by 60 and 86% with two distinct ribozymes, which indicates that the inhibition of HIV production is directly correlated to the decline in spliced and unspliced viral RNAs. These SOFAHDV- ribozymes inhibited the expression and the viral production of four HIV-1 strains, indicating an extended potential to act on multiple HIV variants. In HEK 293T and HeLa cells transfected with pNL4-3 and the SOFA-HDV-ribozymes, the reduced RNA levels consequently decreased the Gag protein expression in the cell and virus production in the supernatant. When transfected before HIV-1 infection, the ribozymes prevented the incoming virus from being expressed. The ribozymes inhibited HIV production up to 90% when transfected in combination with the HIV protease inhibitor Atazanavir. Our results strongly suggest that SOFA-HDV ribozymes have a great potential to target HIV-1 and to be used as therapeutic agents in combination therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil0,407

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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