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Enregistrement W2073311495 · doi:10.1097/pas.0b013e3182772a15

EWSR1 Genetic Rearrangements in Salivary Gland Tumors

2013· article· en· W2073311495 sur OpenAlexaff
Akeesha A. Shah, Robin D. LeGallo, Annemieke van Zante, Henry F. Frierson, Stacey E. Mills, Kenneth W. Berean, Mark J. Mentrikoski, Edward B. Stelow

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Surgical Pathology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSalivary Gland Tumors Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSalivary glandMyoepithelial cellBiologyPathologyTongueFluorescence in situ hybridizationAnatomyGene rearrangementImmunohistochemistryChromosomeMedicineImmunologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Ewing sarcoma breakpoint region 1 (EWSR1) is translocated in many sarcomas. Recently, its rearrangement has been described in salivary gland hyalinizing clear cell carcinomas (HCCCs) and in a subset of soft tissue myoepitheliomas. This study examines the presence of the EWSR1 rearrangement in a variety of salivary gland lesions including classic myoepitheliomas and HCCCs. Using a tissue microarray and whole-mount sections, fluorescence in situ hybridization (FISH) was performed on a variety of salivary gland lesions including HCCCs. The EWSR1 rearrangement was detected in 87% of HCCCs (13 of 15); all other salivary gland lesions including classic myoepitheliomas had intact EWSR1. Patients with HCCCs with rearranged EWSR1 included 1 man, 10 women, and 2 of unknown sex. Ages ranged from 35 to 83 years; the tumor size ranged from 0.8 to 5.5 cm, and the involved locations included: palate (2), base of the tongue (2), mandible (2), submandibular gland (2), lip (1), floor of the mouth (1), sublingual gland (1), inner cheek (1), and nasopharynx (1). All HCCCs were composed of sheets and nests of monotonous cells with clear cytoplasm within a hyalinized stroma. All tested cases were immunoreactive with antibodies to p63 and were nonreactive with antibodies to more conventional myoepithelial antigens (e.g., smooth muscle actin and S100 protein). These findings show that the EWSR1 rearrangement is almost a defining feature of HCCCs and also confirm that classic salivary gland myoepitheliomas are distinct from these tumors and do not share a pathogenetic relationship with their soft tissue counterparts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations118
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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