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Enregistrement W2073311696 · doi:10.1007/s00125-011-2438-4

Novel standards in the measurement of rat insulin granules combining electron microscopy, high-content image analysis and in silico modelling

2012· article· en· W2073311696 sur OpenAlexfundno aff
Eugenio Fava, Jaber Dehghany, Joke Ouwendijk, Andreas Müller, Antje Niederlein, Paul Verkade, Michael Meyer‐Hermann, Michele Solimena

Notice bibliographique

RevueDiabetologia · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesTel Aviv UniversityBundesministerium für Bildung und ForschungMax-Planck-GesellschaftUniversity of AlbertaTechnische Universität DresdenYale University
Mots-clésGranule (geology)ExocytosisInsulinChemistryBiophysicsMembraneBiologyEndocrinologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS/HYPOTHESIS: Knowledge of number, size and content of insulin secretory granules is pivotal for understanding the physiology of pancreatic beta cells. Here we re-evaluated key structural features of rat beta cells, including insulin granule size, number and distribution as well as cell size. METHODS: Electron micrographs of rat beta cells fixed either chemically or by high-pressure freezing were compared using a high-content analysis approach. These data were used to develop three-dimensional in silico beta cell models, the slicing of which would reproduce the experimental datasets. RESULTS: As previously reported, chemically fixed insulin secretory granules appeared as hollow spheres with a mean diameter of ∼350 nm. Remarkably, most granules fixed by high-pressure freezing lacked the characteristic halo between the dense core and the limiting membrane and were smaller than their chemically fixed counterparts. Based on our analyses, we conclude that the mean diameter of rat insulin secretory granules is 243 nm, corresponding to a surface area of 0.19 μm(2). Rat beta cells have a mean volume of 763 μm(3) and contain 5,000-6,000 granules. CONCLUSIONS/INTERPRETATION: A major reason for the lower mean granule number/rat beta cell relative to previous accounts is a reduced estimation of the mean beta cell volume. These findings imply that each granule contains about twofold more insulin, while its exocytosis increases membrane capacitance about twofold less than assumed previously. Our integrated approach defines new standards for quantitative image analysis of beta cells and could be applied to other cellular systems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,117
Score d'incertitude au seuil0,385

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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