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Enregistrement W2073314424 · doi:10.1111/j.1540-8167.2011.02265.x

End‐Recovery QTc: A Useful Metric for Assessing Genetic Variants of Unknown Significance in Long‐QT syndrome

2012· article· en· W2073314424 sur OpenAlexaff
Manoj Obeyesekere, Raymond W. Sy, George J. Klein, Lorne J. Gula, Simon Modi, Susan Conacher, Peter Leong‐Sit, Allan C. Skanes, Raymond Yee, Andrew D. Krahn

Notice bibliographique

RevueJournal of Cardiovascular Electrophysiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineLong QT syndromeQT intervalClinical significanceInternal medicineCardiologySingle-nucleotide polymorphismGenetic testingGenotypeGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Genetic variants represent benign single-nucleotide polymorphisms, disease causing mutations or variants of unknown significance (VUS). Resting, exercise, and recovery QTc intervals have been utilized to detect long-QT syndrome (LQTS) mutations. We sought to provide clinical data that may assist in classifying the presented VUS as disease causing/benign and to determine whether resting and/or end-recovery QT parameters can evaluate the significance of VUS. METHODS AND RESULTS: Twenty-six patients with a VUS in genes associated with LQTS (15 females, age 38 ± 16 years) and 26 age and gender matched controls (age 37 ± 20 years) were included. There were 10 VUS (5 KCNQ1, 4 KCNH2, 1 KCNE1) in 12 families. All but 1 VUS was associated with sudden cardiac death (SCD), aborted SCD or Torsade de pointes. A Schwartz score of ≥3.5 was observed in at least 1 family member with each VUS. Resting QTc was marginally longer in VUS patients compared with controls (458 ± 48 vs 437 ± 25, P = 0.052). A prolonged resting QTc (>470 ms males, >480 ms females) identified 6 VUS carriers and 1 control. VUS carriers had a substantially longer end-recovery QTc (502 ± 68 vs 427 ± 17, P < 0.01) with an end-recovery QTc > 445 ms in 20/26 VUS patients compared to 2/26 controls (P < 0.01). The area under the receiver operating characteristic curve for resting QTc was 0.68 (95% CI, 0.53-0.83, P = 0.03) compared to the end-recovery QTc of 0.88 (95% CI, 0.76-0.99, P < 0.0001). CONCLUSION: Variants in the current study appear to be disease causing. The end-recovery QTc is a useful metric when interpreting LQT VUS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,917
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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