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Enregistrement W2073315283 · doi:10.4161/cc.7.16.6440

p53 binding to the p21 promoter is dependent on the nature of DNA damage

2008· article· en· W2073315283 sur OpenAlexaff
Ewelina Bodzak, Michael Blough, Patrick W.K. Lee, Richard Hill

Notice bibliographique

RevueCell Cycle · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésDNA damageBiologyHistoneDNA repairChromatinChromatin immunoprecipitationCell biologyCell cycleAcetylationCell cycle checkpointTranscriptional regulationDNAApoptosisTranscription (linguistics)Transcription factorMolecular biologyPromoterGene expressionGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

p53 Is a tumor suppressor that integrates signals from different stress induced signalling pathways, regulates cell cycle arrest, senescence, apoptosis and DNA repair. How p53 dictates cell fate is unclear. As a major transcriptional target of p53 in response to cellular stress, p21 is a key component in cell cycle control and apoptosis, directing an anti-apoptotic response following DNA damage. It is therefore likely that p53-dependent regulation of p21 contributes, at least in part, how p53 influences cellular outcome upon DNA damage. Here we compare the p53-dependent transcriptional regulation of p21 in response to DNA damage by ultraviolet (UV) radiation and ionizing radiation (IR). We demonstrate that despite comparable levels of p53 accumulation by both types of DNA damage, IR causes significant, early accumulation of p21 not seen in UV-damaged cells, with a substantially different cell cycle profile. Whereas UV and IR both target p21 protein for degradation immediately after DNA damage, differential post-damage p21 transcription is accountable for the disparity in p21 protein levels. Chromatin immunoprecipitation studies reveal that p53 displays a clear bias against the p21 promoter in UV-damaged cells compared to IR-damaged cells. We note differential post-translational modifications of nuclear p53 between UV and IR treatment. Furthermore we demonstrate that this disparity correlated with reduced histone acetylation on the TATA box within the p21 promoter following UV treatment. This suggests that the nature of DNA damage enables p53 to selectively discriminate between promoters in the induction of target genes, thereby regulating their expression and subsequent cellular outcome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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