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Enregistrement W2073405422 · doi:10.1074/jbc.m110.189605

Phosphoinositide 3-Kinase Regulates Plasma Membrane Targeting of the Ras-specific Exchange Factor RasGRP1

2011· article· en· W2073405422 sur OpenAlexafffund
Bari Zahedi, Hyun-jung Goo, Nadine Beaulieu, Ghazaleh Tazmini, Robert J. Kay, Rosemary B. Cornell

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityUniversity of British ColumbiaTerry Fox Research InstituteBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésDiacylglycerol kinaseCell biologyGuanine nucleotide exchange factorGTPaseSignal transductionPleckstrin homology domainPhospholipase CBiologyBiochemistryChemistryProtein kinase C

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Receptor-induced targeting of exchange factors to specific cellular membranes is the predominant mechanism for initiating and compartmentalizing signal transduction by Ras GTPases. The exchange factor RasGRP1 has a C1 domain that binds the lipid diacylglycerol and thus can potentially mediate membrane localization in response to receptors that are coupled to diacylglycerol-generating phospholipase Cs. However, the C1 domain is insufficient for targeting RasGRP1 to the plasma membrane. We found that a basic/hydrophobic cluster of amino acids within the plasma membrane-targeting domain of RasGRP1 is instead responsible for plasma membrane targeting. This basic/hydrophobic cluster binds directly to phospholipid vesicles containing phosphoinositides via electrostatic interactions with polyanionic phosphoinositide headgroups and insertion of a tryptophan into the lipid bilayer. B cell antigen receptor ligation and other stimuli induce plasma membrane targeting of RasGRP1 by activating the phosphoinositide 3-kinase signaling pathway, which generates phosphoinositides within the plasma membrane. Direct detection of phosphoinositides by the basic/hydrophobic cluster of RasGRP1 provides a novel mechanism for coupling and co-compartmentalizing phosphoinositide 3-kinase and Ras signaling and, in coordination with diacylglycerol detection by the C1 domain, gives RasGRP1 the potential to serve as an integrator of converging signals from the phosphoinositide 3-kinase and phospholipase C pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,584

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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