MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2073412900 · doi:10.3389/fncel.2014.00071

Synaptic vesicle tethering and the CaV2.2 distal C-terminal

2014· article· en· W2073412900 sur OpenAlexaff
Fiona K. Wong, Robert HC Chen, Sabiha R. Gardezi, Qi Li, Elise F. Stanley

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Cellular Neuroscience · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensSynaptive (Canada)Toronto Western Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPDZ domainC-terminusFusion proteinN-terminusChemistryPeptideBiophysicsBinding siteVesicleVoltage-dependent calcium channelCalcium channelTetheringMolecular biologyBiochemistryCell biologyBiologyCalciumAmino acidPeptide sequenceRecombinant DNAGeneMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Evidence that synaptic vesicles (SVs) can be gated by a single voltage sensitive calcium channel (CaV2.2) predict a molecular linking mechanism or "tether" (Stanley, 1993). Recent studies have proposed that the SV binds to the distal C-terminal on the CaV2.2 calcium channel (Kaeser et al., 2011; Wong et al., 2013) while genetic analysis proposed a double tether mechanism via RIM: directly to the C terminus PDZ ligand domain or indirectly via a more proximal proline rich site (Kaeser et al., 2011). Using a novel in vitro SV pull down binding assay, we reported that SVs bind to a fusion protein comprising the C-terminal distal third (C3, aa 2137-2357; Wong et al., 2013). Here we limit the binding site further to the last 58 aa, beyond the proline rich site, by the absence of SV capture by a truncated C3 fusion protein (aa 2137-2299). To test PDZ-dependent binding we generated two C terminus-mutant C3 fusion proteins and a mimetic blocking peptide (H-WC, aa 2349-2357) and validated these by elimination of MINT-1 or RIM binding. Persistence of SV capture with all three fusion proteins or with the full length C3 protein but in the presence of blocking peptide, demonstrated that SVs can bind to the distal C-terminal via a PDZ-independent mechanism. These results were supported in situ by normal SV turnover in H-WC-loaded synaptosomes, as assayed by a novel peptide cryoloading method. Thus, SVs tether to the CaV2.2 C-terminal within a 49 aa region immediately prior to the terminus PDZ ligand domain. Long tethers that could reflect extended C termini were imaged by electron microscopy of synaptosome ghosts. To fully account for SV tethering we propose a model where SVs are initially captured, or "grabbed," from the cytoplasm by a binding site on the distal region of the channel C-terminal and are then retracted to be "locked" close to the channel by a second attachment mechanism in preparation for single channel domain gating.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,475
Score d'incertitude au seuil0,319

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,189
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in Cellular NeuroscienceMême sujetCellular transport and secretionTravaux en français237 207