Detection of SQSTM1/P392L post-zygotic mutations in Paget’s disease of bone
Notice bibliographique
Résumé
Paget's disease of bone (PDB) is transmitted, in one-third of cases, in an autosomal dominant mode of inheritance with incomplete penetrance. The SQSTM1/P392L germinal mutation is the most common mutation associated with PDB. Given the focal nature of PDB, one team of investigators showed that SQSTM1/P392L somatic mutations could occur in pagetic bone lesions in the absence of germinal mutations detectable in the peripheral blood. The objectives of this study were to develop a reliable method to detect SQSTM1/P392L post-zygotic mutations, by optimizing a polymerase chain reaction (PCR)-clamping method reported to be effective in detecting post-zygotic mutations in peripheral blood from patients with fibrous dysplasia; and to evaluate the frequency of this post-zygotic mutation in PDB patients. We used a locked nucleic acid (LNA) specifically designed for the SQSTM1/P392L mutation, which blocks the wild-type allele amplification during the PCR. DNA from 376 pagetic patients and 297 controls, all without any SQSTM1/P392L germinal mutation, was analyzed. We found that 4.8 % of PDB patients and 1.4 % of controls were carriers of this post-zygotic mutation [p = 0.013, OR 3.68 (1.23; 11.00)]. PDB patient carriers of a post-zygotic mutation had a lower number of affected bones and Renier's index than patients carrying a germinal mutation, suggesting a lower disease extension. We also demonstrated that this post-zygotic mutation was restricted to the monocytic lineage. These results confirmed that LNA PCR clamping is effective for the detection of SQSTM1/P392L post-zygotic mutations, which may occur in patients with PDB.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».