Molecular insights into land snail neuropeptides through transcriptome and comparative gene analysis
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Snails belong to the molluscan class Gastropoda, which inhabit land, freshwater and marine environments. Several land snail species, including Theba pisana, are crop pests of major concern, causing extensive damage to agriculture and horticulture. A deeper understanding of their molecular biology is necessary in order to develop methods to manipulate land snail populations. RESULTS: The present study used in silico gene data mining of T. pisana tissue transcriptomes to predict 24,920 central nervous system (CNS) proteins, 37,661 foot muscle proteins and 40,766 hepatopancreas proteins, which together have 5,236 unique protein functional domains. Neuropeptides, metabolic enzymes and epiphragmin genes dominated expression within the CNS, hepatopancreas and muscle, respectively. Further investigation of the CNS transcriptome demonstrated that it might contain as many as 5,504 genes that encode for proteins destined for extracellular secretion. Neuropeptides form an important class of cell-cell messengers that control or influence various complex metabolic events. A total of 35 full-length neuropeptide genes were abundantly expressed within T. pisana CNS, encoding precursors that release molluscan-type bioactive neuropeptide products. These included achatin, allototropin, conopressin, elevenin, FMRFamide, LFRFamide, LRFNVamide, myomodulins, neurokinin Y, PKYMDT, PXFVamide, sCAPamides and several insulin-like peptides. Liquid chromatography-mass spectrometry of neural ganglia confirmed the presence of many of these neuropeptides. CONCLUSIONS: Our results provide the most comprehensive picture of the molecular genes and proteins associated with land snail functioning, including the repertoire of neuropeptides that likely play significant roles in neuroendocrine signalling. This information has the potential to expedite the study of molluscan metabolism and potentially stimulate advances in the biological control of land snail pest species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».