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Enregistrement W2073788452 · doi:10.1046/j.1365-2567.2001.01189.x

The 3′‐untranslated region of human interleukin‐8 mRNA suppresses IL‐8 gene expression

2001· article· en· W2073788452 sur OpenAlexaff
Yi Yu, Kris Chadee

Notice bibliographique

RevueImmunology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésUntranslated regionChloramphenicol acetyltransferaseMolecular biologyGeneBiologyGene expressionReporter geneMessenger RNAThree prime untranslated regionRegulatory sequenceRegulation of gene expressionTranscription (linguistics)Genetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although adenosine/uridine (AU)-rich sequences in the 3'-untranslated region (UTR) of the interleukin-8 (IL-8) gene have been suggested to contribute to its post-transcriptional regulation, the molecular basis whereby this occurs still needs to be understood. To investigate the role of the 3'-UTR on human IL-8 gene regulation, chimeric reporter genes were generated by adding full length or differentially deleted 3'-UTR of the IL-8 gene to chloramphenicol acetyltransferase (CAT). Addition of the entire IL-8 3'-UTR markedly reduced CAT mRNA and protein expression in COS 7 cells. In a reporter gene study, IL-8 3'-UTR destabilized CAT mRNA, which was dependent on active transcription in COS 7 cells. A 357-base sequence (nucleotides (nt) 2387-2743 of genomic DNA) within 3'-UTR, designated e, suppressed CAT gene expression by accelerating CAT mRNA turnover. A 26-base AU-rich sequence (nt 2552-2577) within e, containing four AUUUA pentamers that form two UAUUUAUU and one UUAUUUAU octamers, did not suppress CAT gene expression. However, deletion of the AU-rich sequences attenuated the inhibitory effect of e on CAT gene expression. Elimination of the first 100 bases (nt 2386-2486) attenuated the potency of fragment e, but much weaker than elimination of the first 146 bases (nt 2387-2533). This study gives new insights in unravelling the molecular mechanisms involved in the post-transcriptional regulation of the IL-8 gene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,109
Score d'incertitude au seuil0,538

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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