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Enregistrement W2073827739 · doi:10.1039/b708867a

Cap-independent regulation of gene expression in apoptosis

2007· review· en· W2073827739 sur OpenAlexaff
Tyson E. Graber, Martin Holčı́k

Notice bibliographique

RevueMolecular BioSystems · 2007
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInternal ribosome entry siteTranslation (biology)Cell biologyBiologyProgrammed cell deathProtein biosynthesisCellular stress responseApoptosisGene expressionProteomeIntegrated stress responseUntranslated regionEukaryotic translationMechanism (biology)Messenger RNAGeneGeneticsFight-or-flight response

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Expression of the proteome is tightly regulated at the level of protein synthesis. Translational control is a critical homeostatic mechanism that allows the cell to rapidly change its phenotype in the face of an intra- and extra-cellular environment in constant flux. It is becoming increasingly clear that when it comes to protein translation during cell stress, all mRNAs are not treated equally. The translation of the majority of mRNAs is compromised during cell stresses that induce programmed cell death such as hypoxia, or DNA damage. However, cellular messages harbouring Internal Ribosome Entry Site elements (IRES) within their 5' untranslated regions are insensitive to stress-induced repression of global translation. Instead, these IRES-containing mRNAs use a poorly understood alternative mechanism of translation that allows continued expression of proteins that are required for the cell to recover from a transient stress or to proceed down the path toward apoptotic death. This review will highlight recent literature that suggests why global translation rates are impaired during stress and apoptosis and how these conditions mediate a switch in the mechanism by which pertinent proteins are synthesized. In addition, recent advances towards our understanding of the physiological role and mechanism of IRES-mediated translation in the context of cell stress-induced apoptosis and human disease will be examined.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations74
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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