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Enregistrement W2073991938 · doi:10.1002/yea.1000

Functional characterization of a H<sup>+</sup>/nucleoside co‐transporter (CaCNT) from <i>Candida albicans</i>, a fungal member of the concentrative nucleoside transporter (CNT) family of membrane proteins

2003· article· en· W2073991938 sur OpenAlexafffund
Shaun Loewen, Amy M.L. Ng, Nadira N. Mohabir, Stephen A. Baldwin, Carol E. Cass, James D. Young

Notice bibliographique

RevueYeast · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdenosine and Purinergic Signaling
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilAlberta Heritage Foundation for Medical ResearchCanada Research Chairs
Mots-clésBiologyTransporterNucleosideNucleoside transporterBiochemistryCandida albicansGeneMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human and other mammalian concentrative (Na(+)-linked) nucleoside transport proteins belong to a membrane protein family (CNT, TC 2.A.41) that also includes Escherichia coli H(+)-dependent nucleoside transport protein NupC. Here, we report the cDNA cloning and functional characterization of a CNT family member from the pathogenic yeast Candida albicans. This 608 amino acid residue H(+)/nucleoside symporter, designated CaCNT, contains 13 predicted transmembrane domains (TMs), but lacks the exofacial, glycosylated carboxyl-terminus of its mammalian counterparts. When produced in Xenopus oocytes, CaCNT exhibited transport activity for adenosine, uridine, inosine and guanosine but not cytidine, thymidine or the nucleobase hypoxanthine. Apparent K(m) values were in the range 16-64 micro M, with V(max) : K(m) ratios of 0.58-1.31. CaCNT also accepted purine and uridine analogue nucleoside drugs as permeants, including cordycepin (3'-deoxyadenosine), a nucleoside analogue with anti-fungal activity. Electrophysiological measurements under voltage clamp conditions gave a H(+) to [(14)C]uridine coupling ratio of 1 : 1. CaCNT, obtained from logarithmically growing cells, is the first described cation-coupled nucleoside transporter in yeast, and the first member of the CNT family of proteins to be characterized from a unicellular eukaryotic organism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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