MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2074044440 · doi:10.1021/bp060049u

Regulating Expression of Pyruvate Kinase in <i>Bacillus subtilis</i> for Control of Growth Rate and Formation of Acidic Byproducts

2006· article· en· W2074044440 sur OpenAlexaff
Zhiwei Pan, Τao Zhu, Nathan Domagalski, Saleem A. Khan, Richard R. Koepsel, Michael M. Domach, Mohammad M. Ataai

Notice bibliographique

RevueBiotechnology Progress · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensSanofi (Canada)
Organismes subventionnairesNational Science Foundation
Mots-clésBacillus subtilisPhosphoenolpyruvate carboxykinaseMutantPyruvate kinaseIntracellularBiochemistryEnzymeIntracellular pHChemistryPEP group translocationAcetate kinaseGrowth rateWild typeStrain (injury)Acetic acidBiologyGeneEscherichia coliGlycolysisBacteriaGeneticsAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Our prior work has shown that a pyk mutant of Bacillus subtilis exhibited diminished acidic byproduct accumulation, dramatically elevated phosphoenolpyruvate (PEP) pool, and reduced growth rate. To determine if a low acetate-producing but fast-growing strain of B. subtilis could be developed, we placed the expression of the pyk gene under the control of an inducible promoter. Enzyme measurements proved that PYK activity of the inducible PYK mutant (iPYK) increases with the isopropyl-beta-d-thiogalactopyranoside concentration. Batch growth experiments showed that growth rate and acid formation are closely related to the induction level of pyk. Measurements of cell growth rate and acetate formation of the iPYK mutant at different induction levels revealed that a PYK activity of about 12% of wild-type allows for good growth rate (0.4 h(-)(1) versus 0.63 h(-)(1) of wild-type) and low acetate production (0.26 g/L versus 1.05 g/L of wild-type). This is the first report to our knowledge of a metabolically engineered B. subtilis strain that allows good growth rate and low acid production in batch cultures. Finally, it was found that, by varying the pyk induction level, intracellular PEP concentration can be controlled over a wide range. The intracellular PEP concentration is intimately connected to the regulation of the transport of phosphotransferase system (PTS) sugars in the presence of glucose. Because there is no other method for modulating intracellular PEP levels, this finding represents a major advance in one's ability to dissect the function of the PTS and sugar metabolism in bacteria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,516

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiotechnology ProgressMême sujetBacterial Genetics and BiotechnologyTravaux en français237 207