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Enregistrement W2074079071 · doi:10.1016/j.jalz.2010.03.012

Autopsy consent, brain collection, and standardized neuropathologic assessment of ADNI participants: The essential role of the Neuropathology Core

2010· article· en· W2074079071 sur OpenAlexaboutno aff
Nigel J. Cairns, Lisa Taylor‐Reinwald, John C. Morris

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutopsy Techniques and Outcomes
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingNational Institutes of HealthNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Institute of Neurological Disorders and StrokeAmerican Academy of Neurology
Mots-clésNeuropathologyAutopsyNeuroimagingMedicinePsychologyNeurosciencePathologyDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Our objectives are to facilitate autopsy consent, brain collection, and perform standardized neuropathologic assessments of all Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (ADNI) participants who come to autopsy at the 58 ADNI sites in the USA and Canada. METHODS: Building on the expertise and resources of the existing Alzheimer's Disease Research Center (ADRC) at Washington University School of Medicine, St. Louis, MO, a Neuropathology Core (NPC) to serve ADNI was established with one new highly motivated research coordinator. The ADNI-NPC coordinator provides training materials and protocols to assist clinicians at ADNI sites in obtaining voluntary consent for brain autopsy in ADNI participants. Secondly, the ADNI-NPC maintains a central laboratory to provide uniform neuropathologic assessments using the operational criteria for the classification of AD and other pathologies defined by the National Alzheimer Coordinating Center (NACC). Thirdly, the ADNI-NPC maintains a state-of-the-art brain bank of ADNI-derived brain tissue to promote biomarker and multi-disciplinary clinicopathologic studies. RESULTS: During the initial year of funding of the ADNI Neuropathology Core, there was notable improvement in the autopsy rate to 44.4%. In the most recent year of funding (September 1(st), 2008 to August 31(st) 2009), our autopsy rate improved to 71.5%. Although the overall numbers to date are small, these data demonstrate that the Neuropathology Core has established the administrative organization with the participating sites to harvest brains from ADNI participants who come to autopsy. CONCLUSIONS: Within two years of operation, the Neuropathology Core has: (1) implemented a protocol to solicit permission for brain autopsy in ADNI participants at all 58 sites who die and (2) to send appropriate brain tissue from the decedents to the Neuropathology Core for a standardized, uniform, and state-of-the-art neuropathologic assessment. The benefit to ADNI of the implementation of the NPC is very clear. Prior to the establishment of the NPC in September 2007, there were 6 deaths but no autopsies in ADNI participants. Subsequent to the establishment of the Core there have been 17 deaths of ADNI participants and 10 autopsies. Hence, the autopsy rate has gone from 0% to 59%. The third major accomplishment is the detection of co-existent pathologies with AD in the autopsied cases. It is possible that these co-morbidities may contribute to any variance in ADNI data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,129
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,110
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,129
Score d'incertitude au seuil0,680

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1290,110
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0040,004
Communication savante0,0040,005
Science ouverte0,0040,007
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,009

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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