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Enregistrement W2074156701 · doi:10.1139/g07-012

Screen for new mutations on the 2nd chromosome involved in indirect flight muscle development in Drosophila melanogaster

2007· article· en· W2074156701 sur OpenAlexvenueno aff
Sajesh Babu, Nallur B. Ramachandra

Notice bibliographique

RevueGenome · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Centre for Biological SciencesDepartment of Science and Technology, Ministry of Science and Technology, IndiaIndian Institute of Science
Mots-clésComplementationBiologyGeneticsMyogenesisDrosophila melanogasterMutantGenetic screenAlleleChromosomePhenotypeMutationMutagenesisPenetranceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An extensive ethylmethanesulfonate mutagenesis of Drosophila melanogaster was undertaken to isolate the stronger alleles of 3 indirect flight-muscle mutations. We isolated 17 strong mutant lines, with nearly complete penetrance and expressivity, using direct screening under polarized light, from more than 1700 mutagenized chromosomes. On complementation, we found 11 of these 17 mutant lines to be alleles of 3 indirect flight-muscle mutations (Ifm(2)RU1, 3 noncomplementing lines; ifm(2)RU2, 6 alleles; ifm(2)RU3, 2 alleles) of the previously isolated 8 complementation groups (Ifm(2)RU1to ifm(2)RU8). In addition, we found 6 new complementation groups with strong defects in adult-muscle morphology; we named these ifm(2)RS1 to ifm(2)RS6. All mutant lines were mapped by meiotic recombination, and 5 of the 6 new complementation lines were mapped using chromosome deficiencies. ifm(2)RS1 maps to a region that harbors ifm(2)RU4 (a mutation that was isolated previously); however, theses are not alleles because each complements the other mutation, and the mutant-muscle phenotype is very different. We used direct screening under polarized light to find recessive mutations; although this method was labor intensive, it can be used to identify recessive genes involved in myogenesis, unlike screens for flightlessness or wing-position defects. This screen identifies regions on the second chromosome that harbor probable genes that are likely expressed in the mesoderm and are thought to be involved in myogenesis. This screen has generated valuable resources that will help us to understand the role of many molecular players involved in myogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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