Assessment of Thiopurine S-Methyltransferase Activity in Patients Prescribed Thiopurines: A Systematic Review
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The evidence for testing thiopurine S-methyltransferase (TPMT) enzymatic activity or genotype before starting therapy with thiopurine-based drugs is unclear. PURPOSE: To examine the sensitivity and specificity of TPMT genotyping for TPMT enzymatic activity, reducing harm from thiopurine by pretesting, and the association of thiopurine toxicity with TPMT status in adults and children with chronic inflammatory diseases. DATA SOURCES: MEDLINE, EMBASE, the Cochrane Library, and Ovid HealthSTAR (from inception to December 2010) and BIOSIS and Genetics Abstracts (to May 2009). STUDY SELECTION: Two reviewers screened records and identified relevant studies in English. DATA EXTRACTION: Data on patient characteristics, outcomes, and risk for bias were extracted by one reviewer and independently identified by another. DATA SYNTHESIS: 54 observational studies and 1 randomized, controlled trial were included. Insufficient evidence addressed the effectiveness of pretesting. Genotyping sensitivity to identify patients with low and intermediate TPMT enzymatic activity ranged from 70.33% to 86.15% (lower-bound 95% CI, 54.52% to 70.88%; upper-bound CI, 78.50% to 96.33%). Sparse data precluded estimation of genotype sensitivity to identify patients with low to absent enzymatic activity. Genotyping specificity approached 100%. Compared with noncarriers, heterozygous and homozygous genotypes were both associated with leukopenia (odds ratios, 4.29 [CI, 2.67 to 6.89] and 20.84 [CI, 3.42 to 126.89], respectively). Compared with intermediate or normal activity, low TPMT enzymatic activity was significantly associated with myelotoxicity and leukopenia. LIMITATION: Available evidence was not rigorous and was underpowered to detect a difference in outcomes. CONCLUSION: Insufficient evidence addresses the effectiveness of TPMT pretesting in patients with chronic inflammatory diseases. Estimates of the sensitivity of genotyping are imprecise. Evidence confirms the known associations of leukopenia or myelotoxicity with reduced TPMT activity or variant genotype. PRIMARY FUNDING SOURCE: Agency for Healthcare Research and Quality.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,011 | 0,065 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,013 | 0,009 |
| Bibliométrie | 0,008 | 0,010 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».