Probing Side-Chain Dynamics in High Molecular Weight Proteins by Deuterium NMR Spin Relaxation: An Application to an 82-kDa Enzyme
Notice bibliographique
Résumé
New NMR experiments for the measurement of side-chain dynamics in high molecular weight ( approximately 100 kDa) proteins are presented. The experiments quantify (2)H spin relaxation rates in (13)CH(2)D or (13)CHD(2) methyl isotopomers and, for applications to large systems, offer significant gains both in sensitivity (2-3-fold) and resolution over previously published HSQC schemes. The methodology has been applied to investigate Ile dynamics in the 723-residue, single polypeptide chain enzyme, malate synthase G. Methyl-axis order parameters, S(axis), characterizing the amplitudes of motion of the methyl groups, have been derived from both (13)CH(2)D and (13)CHD(2) probes and are in excellent agreement. The distribution of order parameters is trimodal, reflecting the range of dynamics that are available to Ile residues. A reasonable correlation is noted between and inverse temperature factors from X-ray studies of the enzyme. The proposed methodology significantly extends the range of protein systems for which side-chain dynamics can be studied.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».