Identification and Characterization of Tropomyosin 3 Associated with Granulin-Epithelin Precursor in Human Hepatocellular Carcinoma
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND AND AIM: Granulin-epithelin precursor (GEP) has previously been reported to control cancer growth, invasion, chemo-resistance, and served as novel therapeutic target for cancer treatment. However, the nature and characteristics of GEP interacting partner remain unclear. The present study aims to identify and characterize the novel predominant interacting partner of GEP using co-immunoprecipitation and mass spectrometry. METHODS AND RESULTS: Specific anti-GEP monoclonal antibody was used to capture GEP and its interacting partner from the protein extract of the liver cancer cells Hep3B. The precipitated proteins were analyzed by SDS-PAGE, followed by mass spectrometry and the protein identity was demonstrated to be tropomyosin 3 (TPM3). The interaction has been validated in additional cell models using anti-TPM3 antibody and immunoblot to confirm GEP as the interacting partner. GEP and TPM3 expressions were then examined by real-time quantitative RT-PCR in clinical samples, and their transcript levels were significantly correlated. Elevated TPM3 levels were observed in liver cancer compared with the adjacent non-tumorous liver, and patients with elevated TPM3 levels were shown to have poor recurrence-free survival. Protein expression of GEP and TPM3 was observed only in the cytoplasm of liver cancer cells by immunohistochemical staining. CONCLUSIONS: TPM3 is an interacting partner of GEP and may play an important role in hepatocarcinogenesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».