MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2074390436 · doi:10.1016/j.jalz.2010.05.101

IC‐P‐087: Multivariate Analysis of MRI Data to Discriminate between Groups and Predict Conversion in Alzheimer's Disease

2010· article· en· W2074390436 sur OpenAlexaff
Andrew Simmons, Eric Westman, Yi Zhang, J‐Sebastian Muehlboeck, Catherine Tunnard, D. Louis Collins, Alan C. Evans, Patrizia Mecocci, Bruno Vellas, Magda Tsolaki, Iwona Kłoszewska, Hilkka Soininen, Simon Lovestone, Christian Spenger, Lars‐Olof Wahlund

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMultivariate statisticsCTL*Multivariate analysisCohortMedicinePsychologyInternal medicineAudiologyStatisticsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alzheimer's disease (AD) is one of the most common forms of neurodegenerative disorders connected with gradual loss of cognitive functions such as episodic memory. We used multivariate data analysis, more specifically orthogonal partial least squares to latent structures (OPLS) , to discriminate between subjects with AD, mild cognitive impairment (MCI) and elderly control subjects (CTL) using global and regional MRI volumetric measures. 117 AD patients (mean (sd) age = 75(6) years, MMSE = 21(5)), 122 MCI patients (74(6) years, MMSE = 27(3)) and 112 CTL (73(7) years, MMSE = 29(1)) from the multi-centre European AddNeuroMed study were included. High resolution sagital 3D T1w MP-RAGE datasets were acquired. Automated regional segmentation and manual outlining of the hippocampus were applied. Altogether this yielded 24 different volumetric measures used for OPLS analyses comparing the different patient groups. 17 AD subjects, 12 CTL were randomly selected out of the cohort and the 22 MCI subjects which converted to AD at one year clinical follow-up were left out of the analysis. This was performed to acquire equal group size when creating the models and to have a small external test for validation. Using seven-fold-cross-validation we received a sensitivity of 87% and a specificity of 90% using hippocampal measures alone, comparing AD with CTL. Adding global and regional measures to the hippocampal measurements resulted in a sensitivity of 90% and a specificity of 94%. This increase in sensitivity and specificity resulted in an increase of the positive likelihood ratio from 9 to 15. The original model including all measures could predict 82% of the AD patients and 83% of the CTL correctly from the left out data. Finally, 72% of MCI converters were correctly predicted as AD. Hippocampal volumes, regional temporal gray matter volumes and total CSF volume were particularly important for separation of the groups. Multivariate analysis of regional MRI measures shows excellent potential for distinguishing between AD patients and CTL. Combining MRI measures together resulted in a significantly better classification than using them separately. OPLS also shows potential for predicting conversion from MCI to AD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAlzheimer s & Dementia→Même sujetDementia and Cognitive Impairment Research→Travaux en français237 207→