MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2074413449 · doi:10.4039/tce.2012.29

A “complex” problem: delimiting sibling species boundaries in black flies (Diptera: Simuliidae)

2012· article· en· W2074413449 sur OpenAlexafffund
Ida M. Conflitti, Gerald F. Shields, Douglas C. Currie

Notice bibliographique

RevueThe Canadian Entomologist · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueFreshwater macroinvertebrate diversity and ecology
Établissements canadiensRoyal Ontario MuseumUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGenome Canada
Mots-clésBiologyMonophylySpecies complexTaxonomy (biology)IntrogressionBlack flySibling speciesDNA barcodingEvolutionary biologyLineage (genetic)ZoologyEcologyPhylogeneticsCladeGeneticsPhylogenetic treeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Rapid and recent lineage radiations pose challenges to systematists. Using members of the highly diverse Simulium arcticum Malloch complex, we tested whether the cytochrome c oxidase subunit I (COI) barcoding gene can differentiate black fly sibling species. Members of the S. arcticum complex were monophyletic in relation to two morphospecies and two cryptic species of the Simulium malyschevi Dorogostaisky et al. and Simulium noelleri Friederichs species-groups, respectively. Of five S. arcticum sibling species analysed, only Simulium negativum Adler et al. was monophyletic. No other members of the complex could be distinguished using COI barcodes. The inability to resolve S. arcticum sibling species resulted because (1) haplotypes were shared between species and (2) the distribution of interspecific genetic distances completely overlapped the range of variation within species. Potential sources of incongruence between barcode data and species boundaries include imperfect taxonomy, inadequate genetic information, incomplete lineage sorting, and/or introgressive hybridization. We ruled out imperfect taxonomy because chromosomal, ecological, and distributional evidence support the validity of S. arcticum sibling species. Therefore, current nomenclature should be maintained pending further study. We conclude that one or more of the latter three sources of incongruence could be responsible for the lack of reciprocal monophyly among species of the S. arcticum complex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,497
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Canadian EntomologistMême sujetFreshwater macroinvertebrate diversity and ecologyTravaux en français237 207