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Enregistrement W2074442302 · doi:10.1111/j.1365-2699.2007.01879.x

Refugia in the Cordilleran ice sheet of western North America: chloroplast DNA diversity in the Arctic–alpine plant <i>Oxyria digyna</i>

2008· article· en· W2074442302 sur OpenAlexaffabout
Kendrick L. Marr, Geraldine A. Allen, Richard J. Hebda

Notice bibliographique

RevueJournal of Biogeography · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePolar Research and Ecology
Établissements canadiensRoyal British Columbia Museum
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBeringiaArcticPleistoceneGlacial periodRange (aeronautics)Genetic diversityPhylogeographyEcologyIce sheetGeographyLast Glacial MaximumRefugium (fishkeeping)Physical geographyGeologyBiologyPaleontologyPopulationHabitatArchaeologyOceanographyPhylogenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Aim Late Pleistocene ice sheets are thought to have covered most of western Canada, including all of British Columbia (BC). We examine patterns of genetic variation in an Arctic–alpine plant to evaluate the possibility of full glacial refugia within the area covered by the Cordilleran ice sheet (CIS) and to uncover post‐glacial migration routes. Location Western North America. Methods We sampled 1030 individuals of the Arctic–alpine plant Oxyria digyna from 117 populations distributed over much of its range in western and northern North America. DNA haplotypes were identified using restriction site analysis of two chloroplast DNA intergene spacer regions, psb A‐ trn H and trn T‐L. We examined the geographical distribution of haplotype diversity in relation to latitude, and also compared various indices of diversity in putatively glaciated and unglaciated regions. Patterns of migration were inferred using nested clade analysis. Results We detected a total of 20 haplotypes. High haplotype diversity was found in Beringia, in unglaciated western USA, and in northern BC at 57–59° N, well within the accepted limits of the CIS. Ancestral haplotypes were also centred in northern BC. Main conclusions High genetic diversity of Oxyria digyna is expected in unglaciated regions, but unexpected in northern BC if British Columbia was entirely covered by ice during the late Pleistocene. Our observations suggest the presence of unglaciated areas providing late Pleistocene refugia in northern BC. Such refugia would have important implications for the origins and migrations of many plant and animal species in north‐western North America.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,359

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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