The identification of <b><i>Dictyostelium</i></b> phosphoproteins altered in response to the activation of RasG
Notice bibliographique
Résumé
Dictyostelium RasG has been implicated in the regulation of a variety of cellular processes, including the initiation of development, cell movement, and cytokinesis, but the molecular components of the signaling pathways involved are largely unknown. We used a tetracycline-regulated protein expression system to study the effect of activated RasG, RasG(G12T), expression on the phosphorylation state of Dictyostelium proteins. Over 70 vegetative phosphoprotein components were resolved by two-dimensional (2-D) immunoblot analysis and of these 16 phosphothreonine and three phosphotyrosine protein components were found to reproducibly change upon RasG(G12T) expression. Thirteen of these were recovered from 2-D gels and identified by mass spectrometry of in-gel tryptic digestions. The proteins identified include the signaling proteins RasGEF-R and protein kinase B, the adhesion protein DdCAD-1, the cytoskeletal protein actin, the mitochondrial division protein FtsZA, and proteins involved in translation and metabolism. In addition to the direct demonstration of the phosphorylation of putative downstream targets of RasG activation, these findings reveal previously undetected phosphorylation of several proteins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».