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Enregistrement W2074565879 · doi:10.1158/1538-7445.am2013-2637

Abstract 2637: Examining the function of the serine protease, Granzyme B, in ALK-positive, anaplastic large cell lymphoma.

2013· article· en· W2074565879 sur OpenAlexaff
Joel D. Pearson, Katelynn Rowe, Kayla D. Thew, Jing xi Zhang, Spencer A. Freeman, Robert J. Ingham

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAnaplastic lymphoma kinaseCancer researchGranzymeAnaplastic large-cell lymphomaGranzyme BCytotoxic T cellBiologyLymphomaMedicineImmunologyPathologyT cellPerforinLung cancerGeneticsImmune systemIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Anaplastic lymphoma kinase-positive, anaplastic large cell lymphoma (ALK+ ALCL) is an aggressive non-Hodgkin lymphoma (NHL) that accounts for 10-20% of childhood NHL. The normal cellular counterpart of this malignancy is thought to be an activated T lymphocyte, based on the observations that tumour cells often exhibit clonal T cell receptor gene rearrangements and possess cytotoxic granules containing proteins such as Perforin and serine protease, Granzyme B (GzB). Chromosomal translocations involving the ALK tyrosine kinase gene are the defining characteristic of this lymphoma. These translocations result in the expression of oncogenic ALK fusion proteins (e.g. NPM-ALK), which are able initiate signalling events crucial for the pathogenesis of ALK+ ALCL. We have previously found that signalling initiated by NPM-ALK and the JunB transcription factor contributes to the phenotypic characteristics of ALK+ ALCL by promoting the expression of GzB. GzB is best characterized for its role as an effector molecule used by cytotoxic T lymphocytes and natural killer cells to kill virally infected and transformed cells; however, GzB can also be secreted from different cell types and has the ability to cleave extracellular matrix (ECM) proteins. Furthermore, GzB is expressed in some urothelial and bladder cancers and was shown to promote invasion of bladder cancer cell lines in vitro and GzB expression is associated with a greater level of tumour invasiveness in patients with urothelial cancer. Given these findings, and that NPM-ALK signalling promotes GzB expression in ALK+ ALCL, we hypothesized that GzB plays a role in the pathogenesis of this malignancy by influencing the interaction of ALK+ ALCL cells with ECM proteins. In this regard we hypothesize that GzB released by ALK+ ALCL cells can cleave ECM proteins which may affect the ability of ALK+ ALCL cells to adhere to these ECM proteins and may also promote tumour cell invasion. We have found that ALK+ ALCL cell lines express enzymatically active GzB that has the ability to cleave the ECM proteins, fibronectin and vitronectin. Furthermore, we have found that these cells also release active GzB and we are now examining if GzB expression influences adhesion of ALK+ ALCL cell lines to ECM proteins and whether GzB promotes the invasion of ALK+ ALCL cell lines in vitro. This work will determine if the expression of GzB is more than just a phenotypic characteristic of ALK+ ALCL, and whether this protein may contribute to the invasive potential of this lymphoma. If so, these findings may help to explain why tumour cells are found to be widely disseminated in ALK+ ALCL patients and murine xenograft models. Citation Format: Joel D. Pearson, Katelynn Rowe, Kayla Thew, Jing xi Zhang, Spencer Freeman, Robert J. Ingham. Examining the function of the serine protease, Granzyme B, in ALK-positive, anaplastic large cell lymphoma. [abstract]. In: Proceedings of the 104th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2013 Apr 6-10; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2013;73(8 Suppl):Abstract nr 2637. doi:10.1158/1538-7445.AM2013-2637

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
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