MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2074661823 · doi:10.1371/journal.pntd.0003401

Characterization of the Ca2+-Gated and Voltage-Dependent K+-Channel Slo-1 of Nematodes and Its Interaction with Emodepside

2014· article· en· W2074661823 sur OpenAlexaff
Daniel Kulke, Georg von Samson‐Himmelstjerna, Sandra M. Miltsch, Adrian J. Wolstenholme, Aaron R. Jex, Robin B. Gasser, Cristina Ballesteros, Timothy G. Geary, Jennifer Keiser, Simon Townson, Achim Harder, Jürgen Krücken

Notice bibliographique

RevuePLoS neglected tropical diseases · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueNematode management and characterization studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesBayer HealthCare
Mots-clésBiologyAscaris suumTrichurisCaenorhabditis elegansNematodeHelminthsGeneticsGeneImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cyclooctadepsipeptide emodepside and its parent compound PF1022A are broad-spectrum nematicidal drugs which are able to eliminate nematodes resistant to other anthelmintics. The mode of action of cyclooctadepsipeptides is only partially understood, but involves the latrophilin Lat-1 receptor and the voltage- and calcium-activated potassium channel Slo-1. Genetic evidence suggests that emodepside exerts its anthelmintic activity predominantly through Slo-1. Indeed, slo-1 deficient Caenorhabditis elegans strains are completely emodepside resistant. However, direct effects of emodepside on Slo-1 have not been reported and these channels have only been characterized for C. elegans and related Strongylida. Molecular and bioinformatic analyses identified full-length Slo-1 cDNAs of Ascaris suum, Parascaris equorum, Toxocara canis, Dirofilaria immitis, Brugia malayi, Onchocerca gutturosa and Strongyloides ratti. Two paralogs were identified in the trichocephalids Trichuris muris, Trichuris suis and Trichinella spiralis. Several splice variants encoding truncated channels were identified in Trichuris spp. Slo-1 channels of trichocephalids form a monophyletic group, showing that duplication occurred after the divergence of Enoplea and Chromadorea. To explore the function of a representative protein, C. elegans Slo-1a was expressed in Xenopus laevis oocytes and studied in electrophysiological (voltage-clamp) experiments. Incubation of oocytes with 1-10 µM emodepside caused significantly increased currents over a wide range of step potentials in the absence of experimentally increased intracellular Ca2+, suggesting that emodepside directly opens C. elegans Slo-1a. Emodepside wash-out did not reverse the effect and the Slo-1 inhibitor verruculogen was only effective when applied before, but not after, emodepside. The identification of several splice variants and paralogs in some parasitic nematodes suggests that there are substantial differences in channel properties among species. Most importantly, this study showed for the first time that emodepside directly opens a Slo-1 channel, significantly improving the understanding of the mode of action of this drug class.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,001

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,189
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS neglected tropical diseasesMême sujetNematode management and characterization studiesTravaux en français237 207