Expression and Membrane Assembly of a Transmembrane Region from Neu
Notice bibliographique
Résumé
Transmembrane domains of receptor tyrosine kinases are increasingly seen as key modulatory elements in signaling pathways. The present work addresses problems surrounding expression, isolation, secondary structure recovery, and assembly into membranes, of the relatively large quantities of transmembrane peptides needed to investigate these pathways by NMR spectroscopy. We demonstrate significant correspondence between SDS-PAGE behavior of such peptides and their (2)H NMR spectra in lipid bilayer membranes. A 50-residue peptide, Neu(exp), containing the transmembrane portion of the receptor tyrosine kinase, Neu, was designed for expression in Escherichia coli. The sequence also contained 11-12 amino acids from each side of the transmembrane domain. The common problem of low expressivity of transmembrane peptides was encountered-likely associated with membrane toxicity of the desired gene product. This difficulty was overcome by expressing the peptide as a TrpE fusion protein in a pATH vector to target expression products to inclusion bodies, and subsequently removing the TrpE portion by cyanogen bromide cleavage. Inclusion bodies offered the additional benefits of reduced proteolytic degradation and simplified purification. The presence of a hexa-His tag allowed excellent recovery of the final peptide, while permitting use of denaturing solvents and avoiding the need for HPLC with its attendant adsorption losses. Isolated expressed peptides were found to be pure, but existed as high oligomers rich in beta-structure as evidenced by CD spectroscopy and SDS-PAGE behavior. Dissolution in certain acidic organic solvents led to material with increased alpha-helix content, which behaved in detergent as mixtures of predominantly monomers and dimers-a situation often considered to exist in cell membranes. For purposes of NMR spectroscopy, peptide alanine residues were deuterated in high yield during expression. The same acidic organic solvents used to dissolve and dissociate expressed transmembrane peptides proved invaluable for their assembly into lipid bilayers. Analogous transmembrane peptides from the human receptor tyrosine kinase, ErbB-2, demonstrated related phenomena.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».