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Enregistrement W2074743588 · doi:10.1080/07352689.2014.870420

Transcriptomic, Proteomic, Metabolomic and Functional Genomic Approaches for the Study of Abiotic Stress in Vegetable Crops

2014· article· en· W2074743588 sur OpenAlexaff
Jing Zhuang, Jian Zhang, Xilin Hou, Feng Wang, Ai‐Sheng Xiong

Notice bibliographique

RevueCritical Reviews in Plant Sciences · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Stress Responses and Tolerance
Établissements canadiensAlberta Innovates
Organismes subventionnairesPriority Academic Program Development of Jiangsu Higher Education InstitutionsNatural Science Foundation of Jiangsu ProvinceNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésMetabolomicsAbiotic stressBiologyTranscriptomeBiotechnologyGenomicsProteomicsFunctional genomicsAbiotic componentComputational biologyMolecular breedingGenomeGeneGeneticsBioinformaticsGene expressionEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vegetables are plants or portion of plants cultivated for food with a savory flavor and considerably nutritional value with little protein or fat. The yield and quality of vegetable crops are affected by various abiotic stresses, such as drought, salinity and low and high temperatures. Higher plants have evolved a series of complex responses in order to adapt to a single or multiple stresses. Recently, high-throughput sequencing has brought powerful and efficient research tools that can lead to a better understanding of the molecular mechanisms behind stress in plants. Many molecular markers, functional and regulatory genes have been discovered based on the genome sequencing. The new technologies, such as transcriptome analysis, digital gene expression, deep sequencing of small RNAs, proteomics, metabolomics, etc. should pave new avenues for studying stress resistance in vegetable crops. Here, we review recent progresses in the transcriptomic, proteomic, metabolomic and functional genomic approaches that have been used in the field of abiotic stress with vegetable crops. The perspectives on future research and improvement of vegetable crops through applied genomics are provided.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,602
Score d'incertitude au seuil0,170

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,118
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,157 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations104
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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