MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2074785265 · doi:10.1046/j.1440-169x.2001.00601.x

Analysis of haploid development based on expression patterns of developmental genes in the medaka <i>Oryzias latipes</i>

2001· article· en· W2074785265 sur OpenAlexaff
Kazuo Araki, Hiroyuki Okamoto, Ann C. Graveson, Ichiro Nakayama, Hiroyuki Nagoya

Notice bibliographique

RevueDevelopment Growth & Differentiation · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensBrandon University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOryziasBiologyNotochordEpibolyGastrulationBlastodermGeneticsPloidyEmbryoSomiteZebrafishPhenotypeMesodermCell biologyGeneEmbryogenesisEmbryonic stem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The abnormalities of haploid medaka embryos were characterized by comparative analysis of histologic sections and expression patterns of some developmental marker genes between haploids and diploids to clarify whether medaka haploids are useful for identifying mutants. During gastrulation, an obvious defect was first observed as a delay of epiboly and involution. This delay was shown to be caused not by the perturbation of mesoderm induction, but by widespread cell death and disorganization of cell arrangement in the blastoderm. This disorganization of cell arrangement was also detected in various organs, such as the brain, somite and notochord, at a late developmental stage. Ten days after fertilization, a small head and a short body axis were formed; these changes were also observed in haploid embryos in other species, but their cause is unknown. Based on the expression patterns of HNF3beta and goosecoid, it was demonstrated that a short and impotent prechordal plate induced near the marginal zone in haploid embryos was responsible for this defect. However, in these experiments it was also demonstrated that many major organs in haploids, such as the somite and notochord, differentiated incompletely but were present. Therefore, it was concluded that haploid screening is suitable for identifying mutations revealed by an obvious phenotype, such as dorsoventral polarity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueDevelopment Growth & DifferentiationMême sujetDevelopmental Biology and Gene RegulationTravaux en français237 207