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Enregistrement W2074818088 · doi:10.1021/bc049838s

Enhanced Anti-Rotavirus Action of Human Cystatin C by Site-Specific Glycosylation in Yeast

2004· article· en· W2074818088 sur OpenAlexaff
Soichiro Nakamura, Junya Hata, Makoto Kawamukai, Hideyuki Matsuda, Masahiro Ogawa, Kôsuke Nakamura, Jing Hao, David D. Kitts, Shuryo Nakai

Notice bibliographique

RevueBioconjugate Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral gastroenteritis research and epidemiology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryGlycosylationYeastRotavirusVirologyBiochemistryVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cDNA encoding human cystatin C (HCC) was subjected to site-specific substitution of alanine for serine at the position 37, to obtain the Asn(35)-Lys(36)-Ser(37) sequence that is a signal for asparagine-linked (N-linked) glycosylation of protein in eukaryotes, and was transformed into Pichia pastoris X33. As a result, 1.2 mg/L oligomannosyl HCC with a carbohydrate chain of Man(10)GlcNAc(2) was produced by the Pichia transformant. The oligomannosyl HCC was more stable at the low ionic strength condition of 50 mM potassium phosphate buffer, pH 7.0, than the wild-type. In addition, the oligomannosylation substantially improved the molecular stability of cystatin against an aspartic proteinase, cathepsin D, in which the susceptibility decreased to less than 50% of nonglycosylated one. The anti-rotavirus activity of HCC was substantially enhanced by the site-directed glycosylation using the yeast expression system. A MA-104 cell line was used as a host cell for human rotavirus type-2 Wa strain in this study, to which both the wild-type and oligomannosyl HCCs did not show cytotoxicity at a concentration of 100 mug/mL. More than 80% viability of the host cell infected with 1.0 x 10(5) PFU/mL of rotavirus was conserved under the condition coexisting with 75 mug/mL of the oligomannosyl HCC, which was 15.2% higher than that of wild-type HCC. Thus, the in vitro anti-rotavirus assay indicated that the supplement of a proper amount of the oligomannosyl HCC could be used as an anti-rotavirus agent.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,495

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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