The chloride effect is related to anion binding in determining the rate of iron release from the human transferrin N-lobe
Notice bibliographique
Résumé
The major function of human transferrin is to deliver iron from the bloodstream to actively dividing cells. Upon iron release, the protein changes its conformation from 'closed' to 'open'. Extensive studies in vitro indicate that iron release from transferrin is very complex and involves many factors, including pH, the chelator used, an anion effect, temperature, receptor binding and intra-lobe interactions. Our earlier work [He, Mason and Woodworth (1997) Biochem. J. 328, 439-445] using the isolated transferrin N-lobe (recombinant N-lobe of human transferrin comprising residues 1-337; hTF/2N) has shown that anions and pH modulate iron release from hTF/2N in an interdependent manner: chloride retards iron release at neutral pH, but accelerates the reaction at acidic pH. The present study supports this idea and further details the nature of the dual effect of chloride: the anion effect on iron release is closely related to the strength of anion binding to the apoprotein. The negative effect seems to originate from competition between chloride and the chelator for an anion-binding site(s) near the metal centre. With decreasing pH, the strength of anion binding to hTF/2N increases linearly, decreasing the contribution of competition with the chelator. In the meantime, the 'open' or 'loose' conformation of hTF/2N, induced by the protonation of critical residues such as the Lys-206/Lys-296 pair at low pH, enables chloride to enter the cleft and bind to exposed side chains, thereby promoting cleft opening and synergistically allowing removal of iron by the chelator, leading to a positive anion effect. Disabling one or more of the primary anion-binding residues, namely Arg-124, Lys-206 and Lys-296, substantially decreases the anion-binding ability of the resulting mutant proteins. In these cases, the competition for the remaining binding residue(s) is increased, leading to a negative chloride effect or, at most, a very small positive effect, even at low pH.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».