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Enregistrement W2074870128 · doi:10.1089/104454904322964724

AZT–DNA Interaction

2004· article· en· W2074870128 sur OpenAlexafffund
R. Marty, Amin Ahmed Ouameur, Jean-François Neault, Shohreh Nafisi, Heidar‐Ali Tajmir‐Riahi

Notice bibliographique

RevueDNA and Cell Biology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensUniversité du Québec à Trois-Rivières
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésDNABiologyReverse transcriptaseBinding constantBinding siteMolecular biologyIn vivoBase pairIn vitroZidovudineDNA polymeraseDNA replicationBiochemistryNucleosideNucleotideRNAVirusVirologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Oxidative DNA damage has been reported in fetal tissues by exposure to 3'-azido-3'-deoxythymidine (AZT). AZT has been used effectively for the treatment of human immunodeficiency virus-1 (HIV-1) and AIDS. It showed in vitro to block the nucleoside-binding site of the viral reverse transcriptase and to inhibit DNA replication by chain termination. It incorporates into both nuclear and mitochondrial DNA and is shown to cause cancer in vivo and in vitro. This study was designed to examine the interaction of AZT with DNA in aqueous solution at physiological condition, using different drug/DNA (phosphate) molar ratios (r) of 1/80 to 1/2 and constant DNA concentration of 12.5 mM (phosphate). Capillary electrophoresis, FTIR, and UV-visible difference spectroscopic methods and molecular modeling were used to determine the drug binding sites, the binding constants and the effects of the AZT complexation on DNA conformation. Structural analysis showed that AZT binds to DNA through G-C and A-T base pairs and the backbone PO(2) groups with two binding constants of K(1) = 2.60 x 10(5) M(-1) and K(2) = 1.20 x 10(5) M(-1). The drug distributions are 50% with G-C, 15% with A-T and 35% with the backbone phosphate group. AZT-DNA interaction is associated with a partial B- to A-DNA conformational transition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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