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Enregistrement W2074927481 · doi:10.3389/fgene.2014.00090

Association of CTRC and SPINK1 gene variants with recurrent hospitalizations for pancreatitis or acute abdominal pain in lipoprotein lipase deficiency

2014· article· en· W2074927481 sur OpenAlexafffund
Karine Tremblay, Camélia Dubois-Bouchard, Diane Brisson, Daniel Gaudet

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Genetics · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLipid metabolism and disorders
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversité de MontréalHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésHypertriglyceridemiaMedicinePancreatitisAcute pancreatitisInternal medicineGastroenterologyTriglycerideCholesterol

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: There are important inter-individual variations in the incidence and severity of acute pancreatitis in patients with severe hypertriglyceridemia. Several genes involved in triglyceride-rich lipoprotein metabolism or serine proteases pathways are known to influence the risk of pancreatitis. AIM: To evaluate the association between genes regulating serine proteases, chymotrypsin C (CTRC) and serine peptidase inhibitor kazal type1 (SPINK1), and recurrence of hospitalizations for acute pancreatitis or severe abdominal pain in patients with Lipoprotein Lipase Deficiency (LPLD), a rare and extreme monogenic model of severe hypertriglyceridemia and pancreatitis. METHOD: The CTRC and SPINK1 genes promoter and coding regions sequencing has been performed in a sample of 38 LPLD adults (22 men and 16 women) and 100 controls (53 men and 47 women). Estimation of the association of CTRC and SPINK1 gene variants or combinations of variants with history of hospitalizations for pancreatitis or acute abdominal pain in LPLD was investigated using non-parametric analyses with correction for multiple testing and logistic regression models controlling for age, gender, family history, and life habits. RESULTS: Gene sequencing followed by genotype-stratified analyses of the CTRC and SPINK1 genes in LPLD and controls revealed a positive association between recurrence of hospitalizations and the rs545634 (CTRC)-rs11319 (SPINK1) combination [OR = 41.4 (CI: 2.0-848.0); p = 0.016]. In all models, a positive family history of pancreatitis was a significant predictor of recurrent hospitalizations independently of the contribution of SPINK1 or CTRC (p < 0.001). CONCLUSION: These results suggest that a positive family history of pancreatitis and genetic markers in the serine protease pathways could be associated with a risk of recurrent hospitalization for acute pancreatitis in severe hypertriglyceridemia due to LPLD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,168
Score d'incertitude au seuil0,414

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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