MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2074985863 · doi:10.1111/j.1365-2893.2006.00834.x

Antagonistic expression of hepatitis C virus and alpha interferon in lymphoid cells during persistent occult infection

2007· article· en· W2074985863 sur OpenAlexaff
Tram N. Q. Pham, Patricia M. Mulrooney‐Cousins, S. E. Mercer, Sonya A. MacParland, Małgorzata Inglot, Małgorzata Zalewska, Krzysztof Simon, Tomasz I. Michalak

Notice bibliographique

RevueJournal of Viral Hepatitis · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis C virus research
Établissements canadiensHealth Sciences CentreMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHepatitis C virusBiologyImmunologyImmune systemViral replicationVirologyViral loadInterferonEx vivoDownregulation and upregulationTumor necrosis factor alphaT cellVirusIn vivoGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Detection of residual HCV in individuals with SVR after treatment of CHC can be significantly heightened by analyzing ex vivo mitogen-activated T and B lymphocytes and applying sensitive nucleic acid amplification assays. However, it remained unknown if synergistic activation of lymphocytes and monocytes would further augment HCV detection, if viral replication becomes universally upregulated in treated cells, and if examining sequential sera and lymphoid cells would improve detection of occult infection. Using paired sera and lymphoid cells collected 1 year apart from 17 individuals with normal liver enzymes for up to 72 months after SVR, it was found that simultaneous activation of lymphocytes and monocytes enhanced identification of silent HCV infection and revealed that in some cases monocytes were the principal immune cell type where HCV persisted. Testing of serial samples further increased detection of occult infection. Ultimately, by combining the above two approaches, all individuals with SVR were found to be silent carriers of HCV. Clonal sequencing revealed HCV variations in sera and lymphoid cells and evolution of viral genomes confirming ongoing virus replication. Surprisingly, similar to those with CHC, naive lymphoid cells from some individuals carried approximately 10(3) HCV copies/microg total RNA. HCV loads in naive lymphoid cells predetermined the outcome of ex vivo stimulation with respect to upregulation or inhibition of HCV replication. HCV RNA levels in occult infection were inversely proportional to the expression of IFNalpha and IFN-inducible MxA, but not to IFNgamma or tumour necrosis factor alpha in naive and mitogen-treated lymphoid cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,044
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Viral HepatitisMême sujetHepatitis C virus researchTravaux en français237 207