Identification and potential enzyme capacity of flavobacteria isolated from the rhizosphere of barley (<i>Hordeum vulgare</i> L.)
Notice bibliographique
Résumé
The diversity of 99 flavobacterium-like isolates from a barley rhizosphere is described. They were identified on 1/10 strength tryptic soy agar by their yellowish colour and a flexirubin reaction after exposure to 10% KOH.16S rDNA partial sequencing identified the majority (70%) of isolates as Flavobacterium. Twelve percent of the isolates belonged to other genera in the phylum Bacteroidetes. Finally 17% of the isolates did not belong to the phylum Bacteroidetes. Most of the Flavobacterium isolates were affiliated to various aquatic, validly named species and likely represent a bulk of undescribed soil Flavobacterium species found in especially high numbers in the rhizosphere of young plant roots. Most Flavobacterium isolates showed gliding motility on CY agar and VY/2 agar, whereas none of the other isolates shared this feature. A high percentage of Flavobacterium strains produced enzymes involved in polysaccharide and protein digestion as well as extracellular phosphatases, compared with strains related to other genera in the phylum Bacteroidetes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».