Association between the interleukin‐1 family gene cluster and psoriatic arthritis
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: The interleukin-1 (IL-1) cytokine elicits a wide variety of biologic activities that initiate and promote an inflammatory response. The loci in the IL1 gene cluster have recently been associated with ankylosing spondylitis (AS). Since there is clinical and immunologic overlap between psoriatic arthritis (PsA) and AS, we wanted to examine the association between a panel of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in the IL1 gene family cluster and chromosome 2q12-13 in a PsA cohort. METHODS: Two hundred twelve PsA patients and 150 ethnically matched controls were genotyped with 11 SNPs in IL1A, 9 SNPs in IL1B, and 9 SNPs in IL1F5-10. Univariate analyses of the 29 single markers and short intragenic haplotypes identified several associated regions. Seventeen markers of interest were noted and further investigated to determine which markers or short haplotypes independently predict case-control status, using a stepwise logistic model. RESULTS; Two regions contributing independently to risk of disease in PsA were noted: a region spanned by markers rs3783547, rs3783543, and rs17561 in IL1A, and a region near the end of IL1B, through IL1F7, IL1F8, and into IL1F10. The best model contained markers rs3811047, rs1562304, and rs3811058, and 1 haplotype constructed from the 3 markers in region 1, with a likelihood ratio of 25.34 (4 degrees of freedom). CONCLUSION: The IL1 locus appears to be a high-priority susceptibility locus in PsA, with at least 2 independent regions that confer increased risk.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».