Glutathione as a Prebiotic Answer to α-Peptide Based Life
Notice bibliographique
Résumé
The energetics of peptide bond formation is an important factor not only in the design of chemical peptide synthesis, but it also has a role in protein biosynthesis. In this work, quantum chemical calculations at 10 different levels of theory including G3MP2B3 were performed on the energetics of glutathione formation. The strength of the peptide bond is found to be closely related to the acid strength of the to-be N-terminal and the basicity of the to-be C-terminal amino acid. It is shown that the formation of the first peptide activates the amino acid for the next condensation step, manifested in bacterial protein synthesis where the first step is the formation of an N-formylmethionine dipeptide. The possible role of glutathione in prebiotic molecular evolution is also analyzed. The implications of the thermodynamics of peptide bond formation in prebiotic peptide formation as well as in the preference of α- instead of β- or γ-amino acids are discussed. An empirical correction is proposed for the compensation of the error due to the incapability of continuum solvation models in describing the change of the first solvation shell when a peptide bond is formed from two zwitterions accompanied by the disappearance of one ion pair.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».