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Enregistrement W2075196454 · doi:10.1021/bm050605t

Aggregation of Antifreeze Glycoprotein Fraction 8 and Its Effect on Antifreeze Activity

2005· article· en· W2075196454 sur OpenAlexaff
Vincent Bouvet, Gianni R. Lorello, Robert N. Ben

Notice bibliographique

RevueBiomacromolecules · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesU.S. Public Health ServiceNational Institutes of Health
Mots-clésCircular dichroismAntifreezeAntifreeze proteinChemistryRandom coilAqueous solutionDynamic light scatteringRational designBiophysicsCrystallographyBiochemistryOrganic chemistryBiologyMaterials scienceNanotechnology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Antifreeze glycoproteins (AFGPs) have many potential applications ranging from the cryopreservation and hypothermic storage of tissues and organs to the preservation of various frozen food products. Since supplying native AFGP for these applications is a labor-intensive and costly process, the rational design and synthesis of functional AFGP analogues is a very attractive alternative. While structure-function studies have implicated specific structural motifs as essential for antifreeze activity in AFGP, the relationship between solution conformation and antifreeze activity is poorly understood. Toward this end, we have analyzed AFGP8 in aqueous solutions using dynamic light scattering (DLS) and circular dichroism (CD). Our results indicate that AFGP8 forms discrete aggregates in solution. These aggregates are predominantly composed of dimers that form at solution concentrations greater than 20 mM. CD spectroscopy indicates that the preferred solution conformation of AFGP8 is consistent with that of random coil. However, significant beta-sheet and alpha-helix character is observed in more concentrated solutions, indicating that these glycopeptides are highly flexible in solution. Aggregation appears to have a minimal effect on the overall solution conformation. Thermal hysteresis (TH) activity of the aggregated solutions is much higher than that of less concentrated solutions that do not form aggregates. While cooperative functioning between lower and higher molecular weight AFGPs has been reported, this is the first instance where cooperative functioning in lower molecular weight AFGPs has been observed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,095
Score d'incertitude au seuil0,321

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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