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Enregistrement W2075280620 · doi:10.1093/mutage/geu087

Effect of 8-oxoguanine glycosylase deficiency on aflatoxin B1 tumourigenicity in mice

2015· article· en· W2075280620 sur OpenAlexafffund
Jeanne Mulder, Patricia V. Turner, Thomas E. Massey

Notice bibliographique

RevueMutagenesis · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of GuelphQueen's University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAflatoxinCancer researchDNA glycosylaseGeneBiologyChemistryBiochemistryDNA repairBiotechnology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mycotoxin aflatoxin B1 (AFB1) may initiate cancer by causing oxidatively damaged DNA, specifically by causing 8-oxo-7,8-dihydro-2'-deoxyguanosine (8-oxodG) lesions. Base excision repair removes these lesions, with 8-oxoguanine glycosylase (OGG1) being the rate-limiting enzyme. The aim of this study was to determine the effect of ogg1 deficiency on AFB1-induced oxidatively damaged DNA and tumourigenesis. Female wild-type, heterozygous and homozygous ogg1 null mice were given a single dose of 50mg/kg AFB1 or 40 µl dimethyl sulfoxide (DMSO) ip. Neither ogg1 genotype nor AFB1 treatment affected levels of oxidised guanine in lung or liver 2h post-treatment. AFB1-treated ogg1 null mice showed exacerbated weight loss and mortality relative to DMSO-treated ogg1 null mice, but AFB1 treatment did not significantly increase lung or liver tumour incidence compared with controls, regardless of ogg1 genotype. Suspect lung masses from three of the AFB1-treated mice were adenomas, and masses from two of the mice were osteosarcomas. No osteosarcomas were observed in DMSO-treated mice. All liver masses from AFB1-treated mice were adenomas, and one also contained a hepatocellular carcinoma. In DNA from the lung tumours, the K-ras mutation pattern was inconsistent with initiation by AFB1. In conclusion, ogg1 status did not have a significant effect on AFB1-induced oxidatively damaged DNA or tumourigenesis, but deletion of one or both alleles of ogg1 did increase susceptibility to other aspects of AFB1 toxicity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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