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Enregistrement W2075324183 · doi:10.1097/pai.0b013e3182849826

HER2 In Situ Hybridization in Gastric and Gastroesophageal Adenocarcinoma

2013· article· en· W2075324183 sur OpenAlexaff
Andrea Grin, Christine Brezden‐Masley, Sharon Bauer, Catherine Streutker

Notice bibliographique

RevueApplied immunohistochemistry & molecular morphology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGastric Cancer Management and Outcomes
Établissements canadiensUniversity of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIn situ hybridizationFluorescence in situ hybridizationImmunohistochemistryTrastuzumabFish <Actinopterygii>ConcordanceIn situAdenocarcinomaPathologyGastroesophageal JunctionCancerMedicineBiologyInternal medicineChemistryBreast cancerGene expressionGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Patients with gastric and gastroesophageal junction (GEJ) adenocarcinomas that are HER2 positive by immunohistochemistry (IHC) or in situ hybridization show a significant survival benefit with trastuzumab therapy. In situ hybridization is traditionally done by fluorescence in situ hybridization (FISH), despite some limitations. An alternative is the dual in situ hybridization (Dual ISH) technique that is fully automated and uses differentially labeled CEP17 and HER2 probes that can be read by light microscopy on 1 slide. The aim of this study was to assess the utility of Dual ISH in gastric/GEJ cancer and to compare the results with those obtained by IHC and FISH. Cases of gastric/GEJ adenocarcinoma were analyzed by IHC, FISH, and Dual ISH and the correlation between methods calculated. Results for 50 patients were available. There was a 98% (49/50) concordance rate between Dual ISH and FISH. One discrepant case was nonamplified by FISH but showed focal amplification by Dual ISH. Discrepancy was attributed to tumor heterogeneity, which was a frequent finding (78% of HER2-positive cases). There was excellent correlation between Dual ISH and FISH for assessment of HER2 amplification. Dual ISH was rapid, easy to interpret, and maintained cell morphology, which was valuable in identifying tumor heterogeneity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,874
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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