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Enregistrement W2075388548 · doi:10.1073/pnas.1003124107

Rice pollen hybrid incompatibility caused by reciprocal gene loss of duplicated genes

2010· article· en· W2075388548 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Reproductive Biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsJapan Society for the Promotion of ScienceMinistry of Education, Culture, Sports, Science and Technology
Mots-clésBiologyGeneticsGene duplicationGeneGenomeJaponicaAlleleBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic incompatibility is a barrier contributing to species isolation and is caused by genetic interactions. We made a whole genome survey of two-way interacting loci acting within the gametophyte or zygote using independence tests of marker segregations in an F(2) population from an intersubspecific cross between O. sativa subspecies indica and japonica. We detected only one reproducible interaction, and identified paralogous hybrid incompatibility genes, DOPPELGANGER1 (DPL1) and DOPPELGANGER2 (DPL2), by positional cloning. Independent disruptions of DPL1 and DPL2 occurred in indica and japonica, respectively. DPLs encode highly conserved, plant-specific small proteins (∼10 kDa) and are highly expressed in mature anther. Pollen carrying two defective DPL alleles became nonfunctional and did not germinate, suggesting an essential role for DPLs in pollen germination. Although rice has many duplicated genes resulting from ancient whole genome duplication, the origin of this gene duplication was in recent small-scale gene duplication, occurring after Oryza-Brachypodium differentiation. Comparative analyses suggested the geographic and phylogenetic distribution of these two defective alleles, showing that loss-of-function mutations of DPL1 genes emerged multiple times in indica and its wild ancestor, O. rufipogon, and that the DPL2 gene defect is specific to japonica cultivars.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,063
Score d'incertitude au seuil0,482

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle