Proteomic and microscopic analysis of biofilms formed by<i>Listeria monocytogenes</i>568
Notice bibliographique
Résumé
Biofilm formation may be important in the colonization of the food-processing environment by the food-borne pathogen Listeria monocytogenes. Listeria monocytogenes 568 formed adherent multicellular layers on a variety of test surfaces following growth at 37 degrees C with multiple transfers of the test surface into fresh medium. Microscopic examination of these adherent layers suggest that the cells were surrounded by extracellular material. The presence of a carbohydrate containing extracellular polymeric matrix was confirmed by labelling hydrated adherent layers with fluorescein-conjugated concanavalin A, indicating that these adherent layers are biofilms. To gain insight into the physiological state of cells in these biofilms, the proteomes from biofilm- and planktonic-grown cells from the same cultures were compared using 2-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis. Nineteen proteins, which exhibited higher levels of expression in biofilm-grown cells, were successfully identified from the 2-D gels using a combination of MALDI-TOF and MS/MS. Proteins that were found to be more highly expressed in biofilm-grown cells were involved in stress response, envelope and protein synthesis, biosynthesis, energy generation, and regulatory functions. In biofilm-grown cells, many proteins in the pH range 4-6 ran as multiple spots arranged horizontally across the 2-D gels.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».