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Enregistrement W2075711428 · doi:10.1073/pnas.0510380103

Caspase recruitment domain protein 6 is a microtubule-interacting protein that positively modulates NF-κB activation

2006· article· en· W2075711428 sur OpenAlexaff
Almut Dufner, Scott Pownall, Tak W. Mak

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNF-κB Signaling Pathways
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteTechnische Universität MünchenYale UniversityMedical School, University of MichiganCancer Research Institute
Mots-clésCell biologySignal transductionKinaseBiologyDeath domainScaffold proteinCaspaseMicrotubuleApoptosisProgrammed cell deathBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Proteins containing a caspase recruitment domain (CARD) play pivotal roles in signal transduction leading to apoptosis and NF-kappaB activation and inflammation. Here we identify and characterize human and mouse CARD protein 6 (CARD6), CARD-containing proteins of unique structure. CARD6 associates with microtubules and interacts with receptor-interacting protein (RIP)-like interacting caspase-like apoptosis regulatory protein kinase (RICK), a CARD-containing member of the RIP family of protein kinases. These kinases are involved in multiple NF-kappaB signaling pathways important for innate and adaptive immune responses. Surprisingly, the CARDs of CARD6 and RICK were not required for their interaction; instead, mutational analysis revealed that the CARD of CARD6 negatively controls the association of these molecules. CARD6 also binds to RIP1, a RIP kinase homologue that lacks a CARD but contains a C-terminal death domain. Coexpression of RICK targets CARD6 to aggresomes via a mechanism that requires the CARD of RICK. Importantly, CARD6 expression has a synergistic effect on NF-kappaB activation induced by several independent signal transduction pathways. In summary, our results indicate that CARD6 is a regulator of NF-kappaB activation that modulates the functions of RIP kinase family members.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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