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Enregistrement W2075730880 · doi:10.1128/aem.02363-06

Use of <i>Tetrahymena thermophila</i> To Study the Role of Protozoa in Inactivation of Viruses in Water

2006· article· en· W2075730880 sur OpenAlexafffund
Marcel D.O. Pinheiro, Mary E. Power, Barbara J. Butler, Vivian R. Dayeh, Robin M. Slawson, Lucy E. J. Lee, Denis H. Lynn, Niels C. Bols

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversity of GuelphWilfrid Laurier UniversityUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesCanadian Water Network
Mots-clésTetrahymenaCiliateBiologyProtozoaMicrobiologyBacteriophageVacuoleBacteriaEscherichia coliBiochemistryEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ability of a ciliate to inactivate bacteriophage was studied because these viruses are known to influence the size and diversity of bacterial populations, which affect nutrient cycling in natural waters and effluent quality in sewage treatment, and because ciliates are ubiquitous in aquatic environments, including sewage treatment plants. Tetrahymena thermophila was used as a representative ciliate; T4 was used as a model bacteriophage. The T4 titer was monitored on Escherichia coli B in a double-agar overlay assay. T4 and the ciliate were incubated together under different conditions and for various times, after which the mixture was centrifuged through a step gradient, producing a top layer free of ciliates. The T4 titer in this layer decreased as coincubation time increased, but no decrease was seen if phage were incubated with formalin-fixed Tetrahymena. The T4 titer associated with the pellet of living ciliates was very low, suggesting that removal of the phage by Tetrahymena inactivated T4. When Tetrahymena cells were incubated with SYBR gold-labeled phage, fluorescence was localized in structures that had the shape and position of food vacuoles. Incubation of the phage and ciliate with cytochalasin B or at 4 degrees C impaired T4 inactivation. These results suggest the active removal of T4 bacteriophage from fluid by macropinocytosis, followed by digestion in food vacuoles. Such ciliate virophagy may be a mechanism occurring in natural waters and sewage treatment, and the methods described here could be used to study the factors influencing inactivation and possibly water quality.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,272
Score d'incertitude au seuil0,406

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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