Characterization of sPARP-1
Notice bibliographique
Résumé
Poly(ADP-ribose) polymerase-1 (PARP-1) is an abundant nuclear enzyme that catalyzes the synthesis of poly(ADP-ribose) (pADPr) from its substrate NAD(+) upon binding to DNA strand breaks. Poly(ADP-ribosyl)ation has been implicated in many cellular processes including replication, transcription, and the maintenance of genomic stability. However, studies with mice and cells lacking PARP-1 reveal a critical role for the enzyme in the maintenance of genomic integrity only. Recently, a significant level of poly(ADP-ribose) polymerase activity has been detected in fibroblasts derived from mice lacking PARP-1 following treatment with genotoxic agents (Shieh, W. M., Amé, J-C., Wilson, M. V., Wang, Z-Q., Koh, D. W., Jacobson, M. K., and Jacobson, E. L. (1998) J. Biol. Chem. 273, 30069-30072). We have isolated a cDNA that originates from PARP-1 (-/-) fibroblasts and encodes a polypeptide of 493 amino acid residues bearing poly(ADP-ribose) polymerase activity. This protein, that we named sPARP-1 for short poly(ADP-ribose) polymerase-1, has a calculated mass of 55.3 kDa and is identical in deduced amino acid sequence to the catalytic domain of PARP-1. Radiation hybrid analysis assigned the sPARP-1 gene to the chromosome 1H5-H6 in an immediate proximity to the known location of PARP-1 gene, indicating that sPARP-1 and PARP-1 are most probably products of the same gene. Active sPARP-1 is present in both PARP-1 (+/+) and PARP-1 (-/-) cells as demonstrated by activity-Western blotting and immunostaining using a specific antibody developed against sPARP-1. Like PARP-1, sPARP-1 is localized in the cell nucleus, uses NAD(+) as a substrate and is inhibited by nicotinamide analogues. sPARP-1 produces pADPr of similar length and structure to that of PARP-1. However, contrary to PARP-1, sPARP-1 does not require DNA strand breaks for its activation, although it is stimulated following genotoxic treatments.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».