Structural Characterization of the Highly Cyclized Lantibiotic Paenicidin A via a Partial Desulfurization/Reduction Strategy
Notice bibliographique
Résumé
Lantibiotics are ribosomally synthesized antimicrobial peptides produced by bacteria that are increasingly of interest for food preservation and possible therapeutic uses. These peptides are extensively post-translationally modified, and are characterized by lanthionine and methyllanthionine thioether cross-links. Paenibacillus polymyxa NRRL B-30509 was found to produce polymyxins and tridecaptins, in addition to a novel lantibiotic termed paenicidin A. A bacteriocin termed SRCAM 602 previously reported to be produced by this organism and claimed to be responsible for inhibition of Campylobacter jejuni could not be detected either directly or by genomic analysis. The connectivities of the thioether cross-links of paenicidin A were solved using a novel partial desulfurization/reduction strategy in combination with tandem mass spectrometry. This approach overcame the limitations of NMR-based structural characterization that proved mostly unsuccessful for this peptide. Paenicidin A is a highly cyclized lantibiotic, containing six lanthionine and methyllanthionine rings, three of which are interlocking.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».