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Enregistrement W2075984535 · doi:10.3899/jrheum.140573

Common Variant of PDZK1, Adaptor Protein Gene of Urate Transporters, is Not Associated with Gout

2014· letter· en· W2075984535 sur OpenAlexvenueno aff
Yuzo Takada, Hirotaka Matsuo, Akiyoshi Nakayama, Masayuki Sakiyama, Asahi Hishida, Rieko Okada, Yutaka Sakurai, Toru Shimizu, Kimiyoshi Ichida, Nariyoshi Shinomiya

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Rheumatology · 2014
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGout, Hyperuricemia, Uric Acid
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJikei University School of MedicineGout Research Foundation of JapanNational Defense Medical CollegeKawano Masanori Memorial Public Interest Incorporated FoundationTakeda Science FoundationStrongJapan Society for the Promotion of ScienceMinistry of DefenseAstraZeneca
Mots-clésGoutAbcg2HyperuricemiaMonocarboxylate transporterOrganic anion transporter 1Single-nucleotide polymorphismUric acidTransporterMedicineATP-binding cassette transporterGeneticsGeneBiologyEndocrinologyInternal medicineGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To the Editor: Gout, a multifactorial disease characterized by acute inflammatory arthritis, is caused as a consequence of hyperuricemia. Previous genetic studies have revealed that gout and serum uric acid (SUA) levels have associations with various genes such as ATP-binding cassette transporter, subfamily G, member 2 ( ABCG2/BCRP )1,2,3, glucose transporter 9 ( GLUT9/SLC2A9 )1, organic anion transporter 4 ( OAT4/SLC22A11 )1,4, monocarboxylate transporter 9 ( MCT9/SLC16A9 )1,5, and leukine-rich repeat-containing 16 A ( LRRC16A/CARMIL )1,6. PDZ domain containing 1 ( PDZK1 , also known as NHERF3 ) plays a pivotal role as a scaffolding protein that forms urate transportsome6,7,8,9 with URAT1, ABCG2, and OAT4 (Figure 1). A single-nucleotide polymorphism (SNP), rs12129861, was first reported to have an association between PDZK1 gene and SUA1, which was confirmed by a replication study10. Although the minor allele of rs12129861 is shown to decrease SUA1,10, to the best of our knowledge, no study to date has investigated its association with clinically defined patients with gout. Figure 1. Urate transportsome in the renal tubular cells. PDZK1 (also known as NHERF3) is a scaffolding protein that binds to several urate transporters such as URAT1, OAT4, and NPT1. As for ABCG2, the interaction with PDZK1 is shown to be weak (dotted line)9. … Address correspondence to Dr. H. Matsuo, Department of Integrative Physiology and Bio-Nano Medicine, National Defense Medical College, 3-2 Namiki, Tokorozawa, Saitama 359-8513, Japan. E-mail: hmatsuo{at}ndmc.ac.jp

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0040,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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