Structure of glycerol-3-phosphate dehydrogenase (GPD1) from<i>Saccharomyces cerevisiae</i>at 2.45 Å resolution
Notice bibliographique
Résumé
The interconversion of glycerol 3-phosphate and dihydroxyacetone phosphate by glycerol-3-phosphate dehydrogenases provides a link between carbohydrate and lipid metabolism and provides Saccharomyces cerevisiae with protection against osmotic and anoxic stress. The first structure of a glycerol-3-phosphate dehydrogenase from S. cerevisiae, GPD1, is reported at 2.45 Å resolution. The asymmetric unit contains two monomers, each of which is organized with N- and C-terminal domains. The N-terminal domain contains a classic Rossmann fold with the (β-α-β-α-β)2 motif typical of many NAD+-dependent enzymes, while the C-terminal domain is mainly α-helical. Structural and phylogenetic comparisons reveal four main structure types among the five families of glycerol-3-phosphate and glycerol-1-phosphate dehydrogenases and reveal that the Clostridium acetobutylican protein with PDB code 3ce9 is a glycerol-1-phosphate dehydrogenase.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».