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Enregistrement W2076069439 · doi:10.1186/1472-6947-8-s1-s3

Experiences mapping a legacy interface terminology to SNOMED CT

2008· article· en· W2076069439 sur OpenAlexaff
Geraldine Wade, S. Trent Rosenbloom

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Informatics and Decision Making · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiomedical Text Mining and Ontologies
Établissements canadiensHewlett-Packard (Canada)
Organismes subventionnairesU.S. National Library of Medicine
Mots-clésSNOMED CTTerminologySystematized Nomenclature of MedicineComputer scienceHealth informaticsInterface (matter)Artificial intelligenceInformation retrievalMedicinePathologyLinguistics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: SNOMED CT is being increasingly adopted as the standard clinical terminology for health care applications. Existing clinical applications that use legacy interface terminology need to migrate to the preferred SNOMED CT standard. In this paper, we describe our experience and methodology for mapping concepts from a legacy system to SNOMED CT. METHODS: Our approach includes the establishment of mapping rules between terminologists and back and forth collaboration of the mapped results through one or more iterations in order to reach consensus on the final maps. RESULTS: We highlight our results not only in terms of the number of matches, quality of maps, use of post-coordination, and multiple maps but also include our observations about SNOMED CT including inconsistencies, redundancies and omissions related to our legacy mapping. CONCLUSION: Our methodology and lessons learned from this mapping exercise may be helpful to other terminologists who may be similarly challenged to migrate their legacy terminology to SNOMED CT. This mapping process and resulting discoveries about SNOMED CT may further contribute to refinement of this dynamic, clinical terminology standard.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,037
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,106
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil0,198

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0370,106
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0040,003
Communication savante0,0050,009
Science ouverte0,0040,008
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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