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Enregistrement W2076112470 · doi:10.1002/syn.21628

Striatal development involves a switch in gene expression networks, followed by a myelination event: Implications for neuropsychiatric disease

2012· article· en· W2076112470 sur OpenAlexafffund
Gabriela Novak, Theresa Fan, Brian F. O’Dowd, Susan R. George

Notice bibliographique

RevueSynapse · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesNational Institute on Drug AbuseCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyGenePhenotypeGene expressionNeuroscienceStriatumDopamineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Because abnormal development of striatal neurons is thought to be the part of pathology underlying major psychiatric illnesses, we studied the expression pattern of genes involved in striatal development and of genes comprising key striatal-specific pathways, during an active striatal maturation period, the first two postnatal weeks in rat. This period parallels human striatal development during the second trimester, when prenatal stress is though to lead to increased risk for neuropsychiatric disorders. To identify genes involved in this developmental process, we used subtractive hybridization, followed by quantitative real-time PCR, which allowed us to characterize the developmental expression of over 60 genes, many not previously known to play a role in neuromaturation. Of these 12 were novel transcripts, which did not match known genes, but which showed strict developmental expression and may play a role in striatal neurodevelopment. An additional 89 genes were identified as strong candidates for involvement in this neurodevelopmental process. We show that during the first two postnatal weeks in rat, an early gene expression network, still lacking key striatal-specific signaling pathways, is downregulated and replaced by a mature gene expression network, containing key striatal-specific genes including the dopamine D1 and D2 receptors, conferring to these neurons their functional identity. Therefore, before this developmental switch, striatal neurons lack many of their key phenotypic characteristics. This maturation process is followed by a striking rise in expression of myelination genes, indicating a striatal-specific myelination event. Such strictly controlled developmental program has the potential to be a point of susceptibility to disruption by external factors. Indeed, this period is known to be a susceptibility period in both humans and rats.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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