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Enregistrement W2076117066 · doi:10.1159/000367712

Copy Number Variants in Short Children Born Small for Gestational Age

2014· article· en· W2076117066 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueHormone Research in Paediatrics · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthHospital for Sick ChildrenWellcome Trust
Mots-clésGenome-wide association studyGeneticsCopy-number variationShort statureSingle-nucleotide polymorphismBiologyGeneGenomeGenotypeEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<b><i>Background/Aims:</i></b> In addition to genome-wide association studies (GWAS), height-associated genes may be uncovered by studying individuals with extreme short or tall stature. <b><i>Methods:</i></b> Genome-wide analysis for copy number variants (CNVs), using single nucleotide polymorphism (SNP) arrays, was performed in 49 index cases born small for gestational age with persistent short stature. Segregation analysis was performed, and genes in CNVs were compared with information from GWAS, gene expression in rodents' growth plates, and published information. <b><i>Results:</i></b> CNVs were detected in 13 cases. In 5 children a known cause of short stature was found: UPD7, UPD14, a duplication of the <i>SHOX</i> enhancer region, an<i> IGF1R</i> deletion, and a 22q11.21 deletion. In the remaining 8 cases, potential pathogenic CNVs were detected, either de novo (n = 1), segregating (n = 2), or not segregating with short stature (n = 5). Bioinformatic analysis of the de novo and segregating CNVs suggested that <i>HOXD4</i>, <i>AGPS</i>, <i>PDE11A</i>, <i>OSBPL6</i>, <i>PRKRA </i>and <i>PLEKHA3</i>, and possibly <i>DGKB</i> and <i>TNFRSF11B</i> are potential candidate genes<i>.</i> A <i>SERPINA7</i> or <i>NRK</i> defect may be associated with an X-linked form of short stature. <b><i>Conclusion:</i></b> SNP arrays detected 5 known causes of short stature with prenatal onset and suggested several potential candidate genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,487

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle