Endothelial Nitric-oxide Synthase Antisense (NOS3AS) Gene Encodes an Autophagy-related Protein (APG9-like2) Highly Expressed in Trophoblast
Notice bibliographique
Résumé
Macroautophagy is an intracellular degradation system for the majority of proteins and some organelles that is conserved in all eukaryotic species. The precise role of autophagy in mammalian development and potential involvement in disease remain to be discerned. Yeast Atg9p is the first integral membrane protein shown to be essential for the cytoplasm to vacuole targeting (Cvt) pathway and autophagy, whereas its mammalian functional orthologue has yet to be identified. We have identified two human genes homologous to yeast Atg9p and designated these as APG9L1 and APG9L2. We have previously identified APG9L2 as NOS3AS, which participates in the post-transcriptional regulation of the endothelial nitric-oxide synthase (NOS3) gene on chromosome 7 through its antisense overlap. In human adult tissues, APG9L1 was ubiquitously expressed, whereas APG9L2 was highly expressed in placenta (trophoblast cells) and pituitary gland. In transient transfection assays we found that both proteins were primarily localized to the perinuclear region and also scattered throughout the cytosol as dots, a subset of which colocalized with an autophagosome-specific marker LC3 under starvation conditions. Finally, by the small interfering RNA-mediated knockdown of APG9L1 in HeLa cells, we demonstrated that APG9L1 is essential for starvation-induced autophagosome formation. In addition, APG9L2 can functionally complement APG9L1 in this process. These results, taken together with those of phylogenetic and sequence analyses, suggest that both APG9L1 and APG9L2 are functionally orthologous to the yATG9 in autophagosome formation. Moreover, APG9L2 is a vertebrate-specific gene that may have gained critical roles in mammalian-specific developmental events, such as placentation, through rapid evolution.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».